Den postklassiska epoken, även kallad den sista perioden av pre-spansktalande historia, avbröts av invasionen av spanjorerna i det mesoamerikanska territoriet och den efterföljande erövringen och koloniseringen av Mexiko. Medan miljoner mayaer dog eller åtminstone försvann under den klassiska eraens kollapsår försvann inte maya-civilisationen helt.
De stora städerna i södra låglandet övergavs, och de återstående mayorna förde sin civilisation till norra Yucatán, där de bosatte sig. Så småningom byggde de nya städer. Andra mayastäder expanderade redan. Mayas liv och samhälle fortsatte med en förskjutning av betoning från den klassiska periodens djupa religiositet till ett mer sekulärt samhälle med fokus på ekonomisk tillväxt och välstånd. Denna kultur fortsatte fram till ankomsten av spanjorerna på 1500-talet.
De stora städerna i postklassisk tid inkluderar Chichen-Itza, Uxmal och Mayapán. Andra mayastäder i norra Belize som Santa Rita, Colba och Lamanai blomstrade också, liksom vissa mayagrupper i regionen Petén i Guatemala vid Tayasal och Zacpeten.
Yucatan Maya hade dock några tuffa utmaningar att övervinna, såsom att flytta från en regnskogsmiljö till det mycket torrare Yucatan-klimatet. Yucatan Maya lyckades förändra sitt beroende av ytvattenreservoarer, för användning av grundvattenresurser som underjordiska bassänger och sinkholes som kallas cenotes. Cenote Sagrada fortsätter att vara en helig brunn inom Chichén-Itzá-grunderna. Torrt på ytan håller Yucatán sitt vatten under jorden och låter mayaerna blomstra.
Medan postklassiska mayor i allmänhet flyttade sig bort från prästadömets religiösa dominans och kungarnas gudomliga styre, blev de mer uppmärksamma på regngudarna på grund av Yucatans torrhet. Ristningarna av "Chac", den maya regnguden, täcker byggnaderna i städerna efter den postklassiska perioden, särskilt Uxmal.
Mayaerna kom under påverkan av Toltekerna, ett folk som flyttade till området från Mexiko efter Teotihuacans fall. Skulpturerna och den arkitektoniska stilen återspeglar detta inflytande, liksom mayaerna som offrar Toltecs regngud Tlaloc tillsammans med Chac. Forskare har ännu inte upptäckt Maya och Toltecs exakta politiska och sociala förhållande, men båda kulturerna påverkade den andra.
Chichén-Itzá dominerade Yucatán under de tidiga postklassiska åren från 900 f.Kr. till 1250. Efter Chichén-Itzas nedgång blev dess rivaliserande stad Mayapán dominerande. Mayaerna kunde ha tagit sitt namn från denna stora postklassiska stad. Den maritima handeln kring Yucatán växte under Postclassicens sista år, från 1250 till Spaniens ankomst.
